Indépendamment du choix de la plante, cette forme de culture prend beaucoup de temps et de soins, et il y a des philosophies différentes: Alors qu'il est très commun de prendre plus grandes et vigoureuses plantes et de les couper avec précaution à une plus petite taille et puis les laisser récupérer, la culture à partir de graines n'est pas trop fréquente, car elle retarde la phase de croissance bonsaï d'environ 3 ans. Néanmoins, en partant de zéro, il est possible de choisir parmi différentes semis, et en tant que telle, cette méthode offre la plus grande liberté de conception.
En outre, vous avez la possibilité de cultiver des espèces qui sont très rarement disponibles comme pré-bonsaï, ou d'utiliser des plantes exotiques comme bonsai indoor en intérieur et donc de combiner deux passions horticoles très spéciales.